Neben dem Ausschuss für Fragen der Europäischen Union existiert auch eine auf der Grundlage von Artikel 52 Absatz 3a GG gegründete Europakammer. Die Europakammer kommt immer dann zum Einsatz, wenn Gegenstände beraten werden sollen, die vertraulich zu behandeln sind oder bei denen eine schnelle Reaktion des Bundesrates erforderlich ist. Die Beschlüsse der Europakammer haben dabei die gleiche Rechtswirkung, wie es bei Beschlüssen des Bundesratsplenums der Fall ist, d. h. ihre Beschlüsse gelten als Beschlüsse des Bundesrates.

Über den Bundesrat nehmen die Länder nunmehr auch am so genannten Subsidiaritätsfrühwarnsystem teil, das mit dem am 1. Dezember 2009 in Kraft getretenen Vertrag von Lissabon eingeführt worden ist. Danach können die nationalen Parlamente – in Deutschland also Bundestag und Bundesrat – bereits zu Beginn von EU-Gesetzgebungsverfahren Verstöße gegen das Subsidiaritätsprinzip rügen. Die Landtage werden sich ihrerseits an der Subsidiaritätskontrolle beteiligen.

Über den Bundesrat hinaus koordinieren die Länder ihre europapolitischen Interessen insbesondere in der Konferenz der Europaminister der Länder (EMK) (http://www.europaminister.de). Die in dieser Fachministerkonferenz abgestimmten europapolitischen Positionen werden gegenüber der Bundesregierung und der Europäischen Kommission vertreten. Der Vorsitz wird für ein Jahr von jedem Land in alphabetischer Reihenfolge nacheinander ausgeübt. Auch die übrigen Fachministerkonferenzen positionieren sich regelmäßig zu europapolitischen Themen.